Die Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät wurde am 28.7.1951 gegründet. Sie ist aus der Philosophischen Fakultät hervorgegangen, die Fächer selber existierten schon lange vorher.
Zur Zeit sind rund 60 Professoren in den Instituten für Biochemie, dem Fach Biologie (Institut für Botanik und Landschaftsökologie, Institut für Mikrobiologie, Interfakultäre Institut für Genetik und Funktionelle Genomforschung, und Zoologisches Institut und Museum), dem Institut für Geographie und Geologie, dem Institut für Mathematik und Informatik, dem Institut für Pharmazie und dem Institut für Physik tätig.

Forschungsschwerpunkte sind:
Molekulare Biologie und Medizin (Zusammenarbeit mit der Medizinischen Fakultät)
Regional- und Ressourcenforschung (Landschaftsökologie, Geowissenschaften, Ethik)
Plasmaphysik (Zusammenarbeit mit dem Leibnitz-Institut INP und Max-Planck-Institut IPP)

Bekannte ehemalige Professoren der Fakultät sind:
Gustav MIE (1907-1917), Theoretische Physik
Johannes STARK (1917-1922), Nobelpreis 1919 Physik
Felix HAUSDORFF (1913-1921), Fraktale Mathematik
Werner ROTHMALER (1953-1962), Pflanzensysthematik
Rudolf CREDNER (1881-1908), Geograph
Serge von BUBNOFF (1929-1950), Geologe
Hans BEYER (1947-1970), Organische Chemie
Michael SUCCOW (1992-2006), Alternativer Nobelpreis 1997, Geobotanik